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環(huán)境微生物高通量測序
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環(huán)境微生物高通量測序

環(huán)境微生物高通量測序

依托于大規(guī)模平行測序的新一代測序(NGS)技術(shù),以超高的通量、超強(qiáng)的可擴(kuò)展性和超快的速度對環(huán)境微生物進(jìn)行測序,從而對環(huán)境污染評估、污染治理、環(huán)境修復(fù)以及特種功能微生物進(jìn)行篩選,助力開發(fā)生物資源與環(huán)境保護(hù)。
咨詢服務(wù)

宏基因組:

宏基因組是指特定環(huán)境中全部微生物遺傳物質(zhì)的總和。宏基因組測序以特定環(huán)境中的整個(gè)微生物群落作為研究的對象,不需對微生物進(jìn)行分離培養(yǎng),而是提取環(huán)境微生物總DNA進(jìn)行研究。其擺脫了傳統(tǒng)研究中微生物分離培養(yǎng)的技術(shù)限制,在基因組水平解讀微生物群體的多樣性和豐度,探索微生物與環(huán)境及宿主之間的關(guān)系。

目前,第二代高通量測序技術(shù)在宏基因組的研究上已被廣泛應(yīng)用。第二代高通量測序平臺具有通量高、準(zhǔn)確性高、速度快、信息全等特點(diǎn),加快了宏基因組測序在鑒定低豐度的微生物群落,挖掘更多基因資源方面的應(yīng)用。


全基因組:

細(xì)菌全基因組檢測,是指通過基因組測序和組裝獲得細(xì)菌全基因組序列,并對其進(jìn)行結(jié)構(gòu)和功能研究的方法。依據(jù)研究目標(biāo)所需精細(xì)程度的不同,我們提供了細(xì)菌掃描圖和完成圖兩種不同的解決方案。

全基因組測序的優(yōu)勢:包含微生物的全部遺傳信息,相比16S除了分類信息外還有更多的基因信息;功能基因研究可以找到特定環(huán)境下富集的功能基因。


實(shí)驗(yàn)方法:

檢測平臺:二代高通量平臺,Illumina平臺;


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